Thomas234 : Création de la fiche Antibiogramme (brouillon rédigé par Claude, à relire)

2026-10-21T23:00:11Z

Création de la fiche Antibiogramme (brouillon rédigé par Claude, à relire)

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<div style="border-left: 4px solid #5b8fa8; background-color: #e4eff6; padding: 4px 10px; margin-bottom: 12px; border-radius: 3px; width: fit-content; box-shadow: none; border-top: none; border-right: none; border-bottom: none;">
'''L'antibiogramme teste une bactérie dans un tube, pas un patient dans un lit.''' « Sensible » veut dire « l'antibiotique peut tuer cette bactérie », pas « c'est le bon traitement ».
</div>

=== '''<big>Les deux grandes méthodes</big>''' ===

'''<big>Diffusion en disque (Kirby-Bauer)</big>'''

* Un '''disque imprégné d'antibiotique''' est déposé sur une gélose ensemencée uniformément avec la bactérie.
* L'antibiotique diffuse et crée une '''zone d'inhibition''' dont on mesure le '''diamètre'''.
* Le diamètre est comparé à des seuils pour classer l'isolat en S, I ou R.
* Simple et peu coûteux, mais '''qualitatif''' : il donne une catégorie, '''pas de valeur chiffrée'''.

'''<big>Concentration minimale inhibitrice (CMI)</big>'''

* La '''CMI''' est la '''plus faible concentration d'antibiotique qui inhibe la croissance visible''' de la bactérie, exprimée en mg/L.
* Obtenue par microdilution en bouillon, par bandelette à gradient de concentration, ou par les automates utilisés en routine.
* '''Quantitative''' : elle permet de situer l'isolat par rapport au seuil critique (''breakpoint'') et de suivre une dérive de sensibilité.

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'''On ne compare pas les CMI entre deux antibiotiques différents.''' Une CMI de 0,5 pour une molécule n'est pas « meilleure » qu'une CMI de 4 pour une autre : chaque molécule a ses propres seuils, qui tiennent compte de sa pharmacocinétique et des doses usuelles.
</div>

=== '''<big>Les catégories d'interprétation (CLSI)</big>''' ===

{| class="wikitable" style="border-collapse:collapse"
! style="background:#1f4e68; color:#ffffff; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Catégorie
! style="background:#1f4e68; color:#ffffff; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Signification
|-
| style="background:#dde8f0; color:#1f4e68; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | S — Sensible
| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Succès thérapeutique probable avec la '''posologie usuelle''' approuvée pour ce type d'infection.
|-
| style="background:#dde8f0; color:#1f4e68; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | SDD — Sensible, dépendant de la dose
| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Sensible '''uniquement si on utilise la posologie élevée''' (dose et/ou fréquence maximales approuvées). Un « SDD » traité comme un « S » avec une dose standard est un échec annoncé.
|-
| style="background:#dde8f0; color:#1f4e68; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | I — Intermédiaire
| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Zone tampon : effet incertain. Peut rester utilisable si l'antibiotique '''se concentre au site''' (ex. urines) ou si la dose peut être majorée. À discuter.
|-
| style="background:#dde8f0; color:#1f4e68; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | R — Résistant
| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Échec probable : ne pas utiliser.
|}

Les seuils d'interprétation sont révisés périodiquement par le CLSI ; '''les catégories dépendent de l'espèce bactérienne et du site d'infection'''. Un même antibiotique peut donc avoir des seuils différents selon la bactérie.

=== '''<big>Comment lire un antibiogramme</big>''' ===

# '''Vérifier le prélèvement''' : quel site, quelle date, quelle technique. Un antibiogramme sur un prélèvement de mauvaise qualité ne vaut pas mieux que le prélèvement.
# '''Vérifier l'espèce''' identifiée et se demander si elle est plausible comme pathogène à ce site (voir [[Culture de pus]]).
# '''Lire le profil complet, pas une seule ligne.''' La combinaison des résultats révèle un '''phénotype de résistance''' : BLSE, AmpC, SARM, ERV, carbapénémase. Voir [[Les résistances aux antibiotiques]].
# '''Comprendre ce qui n'est pas affiché.''' Les laboratoires rapportent « en cascade » : les molécules à large spectre ne sont dévoilées que si les molécules de première ligne sont résistantes. Un antibiotique absent du rapport n'est pas forcément inactif — il faut appeler le laboratoire.
# '''Reconnaître les tests complémentaires''' : céfoxitine ou oxacilline pour dépister le SARM, D-test pour la résistance inductible à la clindamycine chez les staphylocoques et les streptocoques, détection des carbapénémases.
# '''Choisir le spectre le plus étroit''' qui couvre le pathogène : c'est tout le but de la culture (voir [[Culture de pus]]).

=== '''<big>Pourquoi un antibiotique « sensible » n'est pas toujours le bon choix</big>''' ===

* '''La pénétration au site''' — l'antibiotique doit s'y rendre. Exemples classiques : la daptomycine est inactivée par le surfactant pulmonaire ; la nitrofurantoïne et la fosfomycine ne traitent que la vessie, jamais une pyélonéphrite ni une bactériémie ; plusieurs molécules ne franchissent pas le LCR, l'os, l'œil ou une prothèse.
* '''Le type d'infection''' — endocardite, méningite, infection sur matériel : il faut un agent '''bactéricide''' et souvent des doses élevées, même si une molécule bactériostatique est rapportée sensible.
* '''Le risque d'émergence de résistance sous traitement''' — l'exemple type : les [[Enterobacter cloacae complex|''Enterobacter'']], [[Serratia marcescens|''Serratia'']] et [[Citrobacter freundii|''Citrobacter'']] porteurs d'une '''AmpC inductible''', qui peuvent devenir résistants aux céphalosporines de 3<sup>e</sup> génération en cours de traitement malgré un antibiogramme « sensible » au départ.
* '''La source n'est pas contrôlée''' — aucun antibiotique ne remplace un drainage, un débridement ou le retrait d'un cathéter infecté.
* '''Le patient''' — allergies, fonction rénale et hépatique, interactions, grossesse, voie d'administration, observance, coût, toxicités.
* '''L'écologie''' — élargir le spectre sans nécessité favorise la résistance et le [[Clostridioides difficile|''C. difficile'']].
* '''Ce qui n'est pas testé''' — l'antibiogramme n'est pas fait de routine pour les anaérobies ni pour plusieurs germes fastidieux ; on se fie alors aux profils de sensibilité habituels de l'espèce.

=== '''<big>Perles cliniques</big>''' ===

* '''Les seuils supposent les posologies standards.''' Choisir une dose plus faible que celle utilisée pour définir le seuil annule la validité du « S ».
* '''Une CMI qui monte d'un cran dans la catégorie « sensible » reste sensible''' — mais chez un patient qui ne répond pas, c'est une information à relayer au microbiologiste.
* '''Un isolat polymicrobien sur un site non stérile''' peut générer un antibiogramme pour une bactérie qui n'est que de la flore. Revenir au prélèvement et à la clinique.
* En cas de doute sur un profil inhabituel, '''appeler le laboratoire ou le microbiologiste de garde''' : c'est plus rapide que d'essayer de deviner.

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Voir aussi : [[Les résistances aux antibiotiques]] · [[Antibiotiques]] · [[Culture de pus]] · [[Tests de laboratoires]]

Antibiogramme - Historique des versions

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