https://microguide.ca/index.php?action=history&feed=atom&title=Tests_mol%C3%A9culaires_%28PCR_et_TAAN%29Tests moléculaires (PCR et TAAN) - Historique des versions2026-10-28T18:15:44ZHistorique des versions pour cette page sur le wikiMediaWiki 1.45.1https://microguide.ca/index.php?title=Tests_mol%C3%A9culaires_(PCR_et_TAAN)&diff=1591&oldid=prevThomas234 : Création de la fiche Tests moléculaires (PCR et TAAN) (brouillon rédigé par Claude, à relire)2026-10-21T23:00:11Z<p>Création de la fiche Tests moléculaires (PCR et TAAN) (brouillon rédigé par Claude, à relire)</p>
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'''Un test moléculaire détecte du matériel génétique, pas un micro-organisme vivant.''' C'est à la fois sa force et sa limite.<br />
</div><br />
<br />
'''TAAN''' = test d'amplification des acides nucléiques (en anglais : NAAT). La '''PCR''' en est la technique la plus répandue.<br />
<br />
=== '''<big>Principe</big>''' ===<br />
<br />
* Le test cible une '''séquence d'ADN ou d'ARN''' propre au micro-organisme recherché.<br />
* Cette séquence est '''amplifiée''' en millions de copies par cycles successifs, puis détectée.<br />
* Le résultat peut être '''qualitatif''' (présent / absent) ou '''quantitatif''' (charge virale, par exemple).<br />
* Un test peut être '''ciblé''' (un seul pathogène) ou '''multiplex''' (panel de plusieurs pathogènes en un seul passage).<br />
<br />
=== '''<big>Ce que ça détecte</big>''' ===<br />
<br />
* '''Panels multiplex''' : respiratoire, gastro-intestinal, méningite/encéphalite, ou identification directe à partir d'une hémoculture positive<br />
* '''Germes difficiles ou longs à cultiver''' : ''Bordetella pertussis'', ''Mycoplasma pneumoniae'', ''Chlamydia trachomatis'', ''Neisseria gonorrhoeae'', ''Legionella'', mycobactéries<br />
* '''Virus''', pour lesquels la culture n'est pas une option de routine<br />
* '''Gènes de résistance ciblés''' : ''mecA'' / ''mecC'' (SARM), ''vanA'' / ''vanB'' (ERV), carbapénémases, etc.<br />
* '''Toxines''' : le gène de la toxine B du [[Clostridioides difficile|''Clostridioides difficile'']] (voir [[Culture de selles]])<br />
<br />
=== '''<big>Forces</big>''' ===<br />
<br />
* '''Rapidité''' : résultat en quelques heures plutôt qu'en quelques jours<br />
* '''Sensibilité élevée''' : détecte de très faibles quantités de matériel génétique<br />
* '''Reste positif malgré l'antibiothérapie''' déjà amorcée, alors que la culture peut être décapitée<br />
* Permet de détecter des pathogènes '''non cultivables de routine'''<br />
<br />
=== '''<big>Limites</big>''' ===<br />
<br />
<div style="border-left: 4px solid #5b8fa8; background-color: #e4eff6; padding: 4px 10px; margin-bottom: 12px; border-radius: 3px; width: fit-content; box-shadow: none; border-top: none; border-right: none; border-bottom: none;"><br />
'''Pas d'antibiogramme.''' Un TAAN ne donne pas de profil de sensibilité : quand on a besoin d'un [[Antibiogramme|antibiogramme]] ou d'une surveillance épidémiologique, '''la culture reste nécessaire'''.<br />
</div><br />
<br />
* '''Détecte de l'ADN/ARN, vivant ou mort''' : le test peut rester positif après la guérison, parfois des semaines (coqueluche, SARS-CoV-2, ''C. difficile'').<br />
* '''Ne distingue pas colonisation et infection''' : un TAAN positif sur un site non stérile doit être interprété avec la clinique. C'est exactement le piège du ''C. difficile'' (porteur sain) et des panels respiratoires.<br />
* '''Ne cherche que ce qui est dans le panel''' : un résultat négatif n'exclut que les cibles testées. Il faut savoir ce que le panel de votre laboratoire contient.<br />
* '''Faux négatifs''' possibles : mauvais site ou mauvais moment de prélèvement, charge sous le seuil de détection, inhibiteurs présents dans l'échantillon, variation génétique de la cible.<br />
* '''Faux positifs''' possibles : contamination du prélèvement ou de l'amplicon.<br />
* Les '''gènes de résistance''' détectés sont partiels : l'absence de gène recherché n'équivaut pas à « sensible », et la présence d'un gène ne prédit pas toujours le phénotype.<br />
* '''Coût''' plus élevé et accès variable selon les centres.<br />
<br />
=== '''<big>Perles cliniques</big>''' ===<br />
<br />
* '''Demandez-vous toujours : est-ce que ce résultat change ma conduite ?''' Un panel multiplex positif chez un patient asymptomatique ne se traite pas.<br />
* Sur une '''hémoculture positive''', la PCR d'identification rapide permet d'ajuster l'antibiothérapie des heures avant l'identification complète — mais l'antibiogramme suit plus tard.<br />
* Un TAAN positif en l'absence de clinique compatible ne fait pas un diagnostic : '''c'est le patient qu'on traite, pas le test'''.<br />
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Voir aussi : [[Culture de selles]] · [[Culture de LCR]] · [[Sérologies]] · [[Tests de laboratoires]]</div>Thomas234