Culture de selles
De Microguide.ca
Autres actions
La culture de selles se fait sur des selles diarrhéiques, chez un patient qui a des symptômes pouvant être associés à une infection gastro-intestinale.
Pathogènes recherchés de routine
- Salmonella sp.
- Shigella sp.
- Campylobacter sp.
- Escherichia coli O157
- Aeromonas sp.
- Plesiomonas sp.
Pour Yersinia et Vibrio, faire une demande spécifique. Sans demande, le rapport négatif ne les mentionne pas.
Délais et rapport préliminaire
- Après 24 h, si rien n'est trouvé : « Recherche négative après 24h d'incubation pour Salmonella, Shigella, E. coli O157, Aeromonas et Plesiomonas. Recherche de Campylobacter en cours. »
- Un rapport préliminaire est émis dès qu'un pathogène est trouvé.
Comment lire le rapport
- Pathogène trouvé : « Présence » de ce pathogène (non quantifié), avec antibiogramme s'il y a lieu.
- « Présence de flore entérique perturbée » : absence d'entérobactéries dans la flore.
- « Absence de flore entérique » : aucune croissance.
- Campylobacter : « recherche sous-optimale » si d'autres bactéries ont trop poussé.
- Staphylococcus aureus et Pseudomonas aeruginosa : rapportés seulement en culture pure ; levures, seulement si prédominantes ou en culture pure.
Antibiogramme
- Fait pour : Salmonella, Shigella, Campylobacter, Aeromonas, Plesiomonas, Vibrio, Yersinia, Edwardsiella tarda.
- Pas pour E. coli O157 : le rapport indique « Traitement antibiotique non indiqué pour ce pathogène ».
E. coli O157 et Shiga-toxines
- La culture cherche E. coli O157. La détection des Shiga-toxines (Stx1 et Stx2, les STEC) est une analyse PCR distincte.
- Un E. coli O157 est d'abord rapporté avec le commentaire « identification présomptive ». Le résultat définitif suit le PCR Shiga-toxine (ou la confirmation par le LSPQ).
Et les tests moléculaires ?
- Des tests moléculaires multiplex (PCR) peuvent augmenter la sensibilité et accélérer le diagnostic, mais la culture reste essentielle pour l'antibiogramme et la surveillance épidémiologique.
- Ces PCR sont généralement réservés aux patients immunosupprimés.
Le Clostridioides difficile
Pour le diagnostic du Clostridioides difficile, ce n'est pas une culture de selles qui est effectuée.
- On procède d'abord à la détection de l'antigène du C. difficile.
- Si positif, on recherche la toxine A et B. Positive = diagnostic confirmé. Négative = équivoque.
- Si équivoque, une TAAN recherche le gène de la toxine B et tranche.
| Détection antigène | Recherche toxine | TAAN / PCR (gène toxine B) |
Interprétation du résultat |
|---|---|---|---|
| + | + | X | Infection |
| − | − | X | Pas d'infection |
| + | − | + | Infection |
| + | − | − | Porteur sain |
« X » = test non effectué / non requis à cette étape de l'algorithme.
Voir aussi : Clostridioides difficile · Tests moléculaires (PCR et TAAN) · Tests de laboratoires