« Culture d'urine » : différence entre les versions

Dernière version du 22 octobre 2026 à 16:08

La culture d'urine sert à identifier l'agent d'une infection urinaire (IU) et à guider l'antibiothérapie. Le laboratoire recherche, compte et identifie les pathogènes urinaires potentiels, et fait l'antibiogramme selon des critères précis.

Prélèvement et transport

Urine du milieu de jet (méthode préférée) après toilette périnéale soigneuse, dans un flacon stérile
Sonde urinaire : prélever après clampage
À envoyer au laboratoire dans les 2 heures, ou garder à 4 °C au maximum 24 h

Le type de prélèvement change le travail du laboratoire

Catégorie	Exemples	Ce que fait le laboratoire
Non invasif	Mi-jet, sonde / sonde à demeure, sac collecteur	Culture 18-24 h. Interprétation selon le nombre d'organismes et de colonies.
Invasif mineur	Cathétérisme, auto-cathétérisme, cystoscopie	Culture 18-24 h. Jusqu'à 3 pathogènes à ≥ 10 colonies sont identifiés avec antibiogramme.
Invasif majeur	Ponction sus-pubienne, néphrostomie, pyélostomie	Culture 48 h. Tout organisme est identifié, peu importe le nombre de colonies.

Préciser le mode de prélèvement sur la requête.

Comment lire le décompte

Le résultat est rapporté en UFC/L. La conversion dépend de l'anse utilisée (1 µL ou 10 µL) :

Colonies sur la gélose	Anse 1 µL	Anse 10 µL
1-9	≥ 10⁶ à < 10⁷ UFC/L	≥ 10⁵ à < 10⁶ UFC/L
10-99	≥ 10⁷ à < 10⁸ UFC/L	≥ 10⁶ à < 10⁷ UFC/L
≥ 100	≥ 10⁸ UFC/L	≥ 10⁷ UFC/L

Pour un prélèvement non invasif avec un seul organisme : un pathogène potentiel à ≥ 10 colonies est identifié avec antibiogramme ; < 10 colonies = contamination probable.
Culture négative : « Culture négative < 10⁶ UFC/L » ou « < 10⁵ UFC/L », selon l'anse utilisée.

« Contamination probable » au rapport

« Contamination probable : X espèce(s), un autre prélèvement pourrait être utile si cliniquement indiqué. » Aucun germe n'est travaillé.
« Associé(s) à X espèce(s) contaminante(s) » : un pathogène est rapporté, accompagné d'autres germes non significatifs.
Écrire « tout travailler » sur la requête ne change rien : le laboratoire applique le protocole. Un antibiogramme peut être fait après entente avec le microbiologiste.

Germes rapportés

Pathogènes potentiels

Bacilles à Gram négatif : par exemple E. coli, Klebsiella spp., Proteus mirabilis, Pseudomonas aeruginosa
Enterococcus sp.
Staphylococcus saprophyticus
Staphylococcus aureus : une bactériurie à S. aureus est toujours suspecte ; rechercher une bactériémie (voir Hémocultures)
Streptocoque β-hémolytique, surtout le groupe B chez la femme enceinte
Plus rarement : levures, staphylocoque à coagulase négative, Aerococcus

Habituellement considérés comme de la flore

Streptococcus du groupe viridans, Lactobacillus, bactéries corynéformes, anaérobies

Piège : la grossesse

Chez la femme de 15 à 45 ans, le Streptococcus agalactiae est rapporté peu importe la quantité. Son antibiogramme est fait seulement si la requête mentionne une grossesse (ou si l'urine provient d'un centre d'obstétrique ou d'une clinique de suivi de grossesse).

Demandes spéciales

Recherche de levures ou d'anaérobies : sur demande.
Antifongigramme : seulement à la demande du médecin.

Voir aussi : Antibiogramme · MALDI-TOF · Tests de laboratoires

@@ Ligne 1 : / Ligne 1 : @@
-La culture d'urine est un examen de microbiologie de base en infectiologie, essentiel pour le diagnostic des infections urinaires (IU). Elle permet d'identifier l'agent pathogène responsable et de guider l'antibiothérapie.
+La culture d'urine sert à identifier l'agent d'une infection urinaire (IU) et à guider l'antibiothérapie. Le laboratoire recherche, compte et identifie les pathogènes urinaires potentiels, et fait l'antibiogramme selon des critères précis.
-=== '''<big>Comment est réalisée une culture d'urine en laboratoire ?</big>''' ===
+=== '''<big>Prélèvement et transport</big>''' ===
-'''<big>a) Type d'échantillon</big>'''
+* '''Urine du milieu de jet''' (méthode préférée) après toilette périnéale soigneuse, dans un flacon stérile
+* '''Sonde urinaire''' : prélever après clampage
+* À envoyer au laboratoire dans les '''2 heures''', ou garder à 4 °C au maximum 24 h
-* '''Urine du milieu de jet''' (méthode préférée) après toilette périnéale soigneuse, recueillie dans un flacon stérile
+=== '''<big>Le type de prélèvement change le travail du laboratoire</big>''' ===
-* '''Sonde urinaire''' : échantillon prélevé après clampage, '''jamais sur le sac collecteur'''
-* '''Ponction sus-pubienne''' (rare), souvent chez le nourrisson
-'''<big>b) Transport</big>'''
+{| class="wikitable" style="border-collapse:collapse"
+! style="background:#1f4e68; color:#ffffff; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Catégorie
+! style="background:#1f4e68; color:#ffffff; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Exemples
+! style="background:#1f4e68; color:#ffffff; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Ce que fait le laboratoire
+|-
+| style="background:#dde8f0; color:#1f4e68; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Non invasif
+| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Mi-jet, sonde / sonde à demeure, sac collecteur
+| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Culture 18-24 h. Interprétation selon le nombre d'organismes et de colonies.
+|-
+| style="background:#dde8f0; color:#1f4e68; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Invasif mineur
+| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Cathétérisme, auto-cathétérisme, cystoscopie
+| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Culture 18-24 h. Jusqu'à 3 pathogènes à ≥ 10 colonies sont identifiés avec antibiogramme.
+|-
+| style="background:#dde8f0; color:#1f4e68; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Invasif majeur
+| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Ponction sus-pubienne, néphrostomie, pyélostomie
+| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Culture 48 h. '''Tout organisme est identifié, peu importe le nombre de colonies.'''
+|}
-* À envoyer au laboratoire dans les '''2 heures''', ou conservée à 4 °C pendant un maximum de 24 h pour éviter la multiplication bactérienne
+'''Préciser le mode de prélèvement sur la requête.'''
-'''<big>c) Ensemencement</big>'''
+=== '''<big>Comment lire le décompte</big>''' ===
-* Le technicien utilise une '''anse calibrée''' (souvent 1 µL ou 10 µL) pour ensemencer une gélose (généralement '''CLED''' ou '''MacConkey''')
+Le résultat est rapporté en '''UFC/L'''. La conversion dépend de l'anse utilisée (1 µL ou 10 µL) :
-* Incubation à '''35-37 °C pendant 18 à 24 h'''
-=== '''<big>Seuils d'interprétation</big>''' ===
 {| class="wikitable" style="border-collapse:collapse"
-! style="background:#1f4e68; color:#ffffff; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Contexte
+! style="background:#1f4e68; color:#ffffff; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Colonies sur la gélose
-! style="background:#1f4e68; color:#ffffff; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Seuil significatif
+! style="background:#1f4e68; color:#ffffff; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Anse 1 µL
+! style="background:#1f4e68; color:#ffffff; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Anse 10 µL
 |-
-| style="background:#dde8f0; color:#1f4e68; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Infection urinaire typique chez la femme ou l'homme
+| style="background:#dde8f0; color:#1f4e68; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | 1-9
-| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | ≥ 10<sup>8</sup> UFC/L
+| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | ≥ 10<sup>6</sup> à < 10<sup>7</sup> UFC/L
+| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | ≥ 10<sup>5</sup> à < 10<sup>6</sup> UFC/L
 |-
-| style="background:#dde8f0; color:#1f4e68; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Ponction sus-pubienne
+| style="background:#dde8f0; color:#1f4e68; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | 10-99
-| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Toute croissance
+| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | ≥ 10<sup>7</sup> à < 10<sup>8</sup> UFC/L
+| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | ≥ 10<sup>6</sup> à < 10<sup>7</sup> UFC/L
 |-
-| style="background:#dde8f0; color:#1f4e68; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Culture polymicrobienne avec < 10<sup>8</sup> UFC/L
+| style="background:#dde8f0; color:#1f4e68; font-weight:bold; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | ≥ 100
-| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | Souvent considérée comme une contamination
+| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | ≥ 10<sup>8</sup> UFC/L
+| style="background:#f3f8fb; border:1px solid #c4d6e4; padding:6px 10px;" | ≥ 10<sup>7</sup> UFC/L
 |}
-=== '''<big>Quels germes sont généralement rapportés ?</big>''' ===
+* Pour un prélèvement non invasif avec un seul organisme : un pathogène potentiel à '''≥ 10 colonies''' est identifié avec antibiogramme ; '''< 10 colonies''' = contamination probable.
+* Culture négative : « Culture négative < 10<sup>6</sup> UFC/L » ou « < 10<sup>5</sup> UFC/L », selon l'anse utilisée.
+=== '''<big>« Contamination probable » au rapport</big>''' ===
+* « '''Contamination probable''' : X espèce(s), un autre prélèvement pourrait être utile si cliniquement indiqué. » Aucun germe n'est travaillé.
+* « Associé(s) à X espèce(s) contaminante(s) » : un pathogène est rapporté, accompagné d'autres germes non significatifs.
+* Écrire « tout travailler » sur la requête ne change rien : le laboratoire applique le protocole. Un antibiogramme peut être fait '''après entente avec le microbiologiste'''.
-<div style="border-left: 4px solid #5b8fa8; background-color: #e4eff6; padding: 4px 10px; margin-bottom: 12px; border-radius: 3px; width: fit-content; box-shadow: none; border-top: none; border-right: none; border-bottom: none;">
+=== '''<big>Germes rapportés</big>''' ===
-'''Seuls les germes pathogènes ou potentiellement pathogènes sont identifiés et testés en antibiogramme.'''
-</div>
-'''<big>a) Bactéries uropathogènes fréquentes</big>'''
+'''Pathogènes potentiels'''
-* [[Escherichia coli|''Escherichia coli'']]
+* Bacilles à Gram négatif : par exemple [[Escherichia coli|''E. coli'']], [[Klebsiella spp|''Klebsiella'' spp.]], [[Proteus mirabilis|''Proteus mirabilis'']], [[Pseudomonas aeruginosa|''Pseudomonas aeruginosa'']]
-* [[Klebsiella spp|''Klebsiella'' spp.]]
+* [[Entérocoques faecium/faecalis|''Enterococcus'' sp.]]
-* [[Proteus mirabilis|''Proteus mirabilis'']]
-* [[Entérocoques faecium/faecalis|''Enterococcus'' spp.]]
-* [[Pseudomonas aeruginosa|''Pseudomonas aeruginosa'']]
 * ''Staphylococcus saprophyticus''
+* [[Staphylococcus aureus|''Staphylococcus aureus'']] : une bactériurie à ''S. aureus'' est '''toujours suspecte''' ; rechercher une bactériémie (voir [[Hémocultures]])
+* Streptocoque β-hémolytique, surtout le groupe B chez la femme enceinte
+* Plus rarement : levures, staphylocoque à coagulase négative, ''Aerococcus''
+'''Habituellement considérés comme de la flore'''
+* ''Streptococcus'' du groupe viridans, ''Lactobacillus'', bactéries corynéformes, anaérobies
+=== '''<big>Piège : la grossesse</big>''' ===
+Chez la femme de 15 à 45 ans, le ''[[Streptocoque du groupe B (Streptocoque agalactiae)|Streptococcus agalactiae]]'' est rapporté peu importe la quantité. Son antibiogramme est fait '''seulement si la requête mentionne une grossesse''' (ou si l'urine provient d'un centre d'obstétrique ou d'une clinique de suivi de grossesse).
-'''<big>b) Autres germes parfois rapportés selon le contexte</big>'''
+=== '''<big>Demandes spéciales</big>''' ===
-* ''Candida'' spp.
+* Recherche de '''levures''' ou d''''anaérobies''' : sur demande.
-* [[Staphylococcus aureus|''Staphylococcus aureus'']] — une bactériurie à ''S. aureus'' est '''toujours suspecte''' : rechercher une bactériémie (voir [[Hémocultures]])
+* '''Antifongigramme''' : seulement à la demande du médecin.
 ----
 Voir aussi : [[Antibiogramme]] · [[MALDI-TOF]] · [[Tests de laboratoires]]