Culture de pus
Autres actions
Rôles d'une culture de pus
La culture sert à identifier l'agent causal d'une infection, pas à prouver l'existence d'une infection : on effectue la culture seulement si on suspecte une infection.
- Réduire le spectre des antibiotiques initialement débutés
- Détecter des germes résistants
- Peut modifier la durée de traitement
Pus superficiel ou pus profond
Le laboratoire a deux protocoles différents.
| Superficiel | Profond | |
|---|---|---|
| Type de site | La plupart des sites non stériles | Sites normalement stériles Liquides pouvant contenir de la flore (drain, bile) |
| Présence de flore | Oui | Possible |
| Prélèvement | Écouvillon | Aspiration idéalement Biopsie / tissu Matériel prothétique Écouvillon (selon critères) |
| Bactéries recherchées | Aérobes | Aérobes Anaérobes |
| Durée de la culture | 2 jours | Aérobie : 3 jours Anaérobie : 4 à 7 jours Matériel prothétique : 14 jours |
Piège : l'écouvillon sans contexte
Un écouvillon sans précision est travaillé comme un pus superficiel : pas de recherche d'anaérobies.
Il est traité comme un pus profond seulement s'il est, par exemple :
- Prélevé au bloc opératoire ou en radiologie
- Accompagné d'une mention d'ostéite, d'arthrite septique ou de prothèse
- Une demande spéciale du prescripteur
Inscrire le site exact et le contexte clinique sur la requête.
Le Gram : le premier résultat disponible
Il est rapporté selon :
- Le Gram (+ ou −) et la forme (bacille, cocci, chaîne, amas, etc.)
- Un score de GB et de bactéries (nombre de +)
| Quantité | Globules blancs (100X) | Morphologie bactérienne (1000X) |
|---|---|---|
| + | 0-1 | 0-1 |
| ++ | 2-5 | 2-9 |
| +++ | 6-30 | 10-25 |
| ++++ | > 30 | > 25 |
Voir aussi la classification bactérienne.
Interpréter l'examen direct
- GB : corrèlent avec le pus et le risque d'infection. Un patient neutropénique peut n'avoir aucun GB malgré une infection.
- Bactéries dans un site stérile = infection.
- Plusieurs morphologies : flore probable vs infection polymicrobienne, selon la clinique et le site.
- Examen direct négatif : diminue la probabilité, n'exclut pas. Ne jamais arrêter les antibiotiques sur un examen direct négatif.
- Faux négatifs : mauvaise technique, délai de transport, antibiotiques reçus avant, infection paucibacillaire (cellulite).
Que veulent dire les « + » de la culture ?
Ils reflètent la quantité de colonies sur la gélose. Plus la bactérie pousse loin sur la gélose (2e et 3e quadrants), plus l'inoculum était grand.
| Quantification | 1er quadrant | 2e quadrant | 3e quadrant |
|---|---|---|---|
| + | < 10 colonies | − | − |
| ++ | ≥ 10 colonies | < 5 colonies | − |
| +++ | > 10 colonies | > 5 colonies | < 5 colonies |
| ++++ | > 10 colonies | > 5 colonies | ≥ 5 colonies |
Flore et pathogènes au rapport
- Superficiel : la flore est rapportée par type (cutanée, oro-pharyngée, vaginale, entérique). Certains pathogènes sont toujours rapportés avec antibiogramme, par exemple S. aureus et S. pyogenes.
- Profond : ≤ 3 micro-organismes = tous rapportés avec antibiogramme. ≥ 4 = le laboratoire consulte le microbiologiste ; le rapport peut alors indiquer une flore.
Concordance examen direct ↔ culture
Lecture de la culture à 24 h, puis à 48 h : être patient avant de conclure.
| Culture négative à 48 h | Culture positive | |
|---|---|---|
| Examen direct négatif | Concordant. Infection cliniquement : on continue. Sinon : on peut arrêter. | Pas de discordance (l'examen direct n'est pas sensible à 100 %). |
| Examen direct positif | Discordance. Réévaluer la clinique ; si +++ ou ++++, penser à une flore ; sinon, appeler le laboratoire ou le microbiologiste de garde. | Mêmes Gram ou Gram supplémentaires : concordant, ajuster la thérapie. Gram discordants : le laboratoire révise l'examen direct. |
Voir aussi : MALDI-TOF · Antibiogramme · Tests de laboratoires