Culture de selles
De Microguide.ca
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La culture de selles en laboratoire commence par l'ensemencement d'un échantillon de selles diarrhéiques sur des milieux sélectifs et différentiels adaptés.
Comment est réalisée une culture de selles ?
- Les milieux couramment utilisés incluent la gélose MacConkey, la gélose Hektoen, la gélose XLD (xylose lysine désoxycholate) et la gélose Campylobacter, permettant d'isoler respectivement les entérobactéries (Salmonella, Shigella), Campylobacter et d'autres pathogènes entériques.
- Après incubation (généralement 24-48 h à 35-37 °C), les colonies suspectes sont identifiées par des tests biochimiques, sérologiques ou par spectrométrie de masse (MALDI-TOF).
- La détection de Shiga-toxine (pour les STEC) se fait par immuno-essai ou par amplification génique (TAAN).
Pathogènes typiquement recherchés et rapportés
Les pathogènes typiquement recherchés et rapportés dans les résultats de culture standard sont :
- Salmonella spp.
- Shigella spp.
- Campylobacter spp.
- Escherichia coli producteurs de Shiga-toxine (STEC, dont O157:H7)
- Aeromonas spp.
- Plesiomonas spp.
La recherche d'autres bactéries (Yersinia, Vibrio…) nécessite une demande spécifique et des milieux particuliers.
Et les tests moléculaires ?
- Les laboratoires peuvent également utiliser des tests moléculaires multiplex (PCR) pour augmenter la sensibilité et accélérer le diagnostic, mais la culture reste essentielle pour l'antibiogramme et la surveillance épidémiologique.
- Les PCR sont généralement réservés aux patients immunosupprimés. Ils permettent toutefois d'identifier la présence de plus de 10 pathogènes différents.
Le Clostridioides difficile
Pour le diagnostic du Clostridioides difficile, ce n'est pas une culture de selles qui est effectuée.
La démarche est la suivante :
- On procède d'abord à la détection de l'antigène du C. difficile.
- Si le résultat est positif, on recherche la toxine A et B du C. difficile.
- Si le résultat est positif = diagnostic confirmé
- Si le résultat est négatif = c'est équivoque (antigène + et toxine −)
- On procède alors par TAAN à la recherche du gène de la toxine B. Celui-ci confirmera ou infirmera le diagnostic.
| Détection antigène | Recherche toxine | TAAN / PCR (gène toxine B) |
Interprétation du résultat |
|---|---|---|---|
| + | + | X | Infection |
| − | − | X | Pas d'infection |
| + | − | + | Infection |
| + | − | − | Porteur sain |
« X » = test non effectué / non requis à cette étape de l'algorithme.
Voir aussi : Clostridioides difficile · Tests moléculaires (PCR et TAAN) · Tests de laboratoires